Wydział Filologiczny
· Instytut Filologii Angielskiej - http://www.ifa.filg.uj.edu.pl/
· Instytut Filologii Germańskiej - http://www.ifg.filg.uj.edu.pl/
· Instytut Filologii Klasycznej - http://www.ifk.filg.uj.edu.pl/
· Instytut Filologii Orientalnej - http://www.ifo.filg.uj.edu.pl/
· Instytut Filologii Romańskiej - http://www.ifr.filg.uj.edu.pl
· Instytut Filologii Słowiańskiej - http://www.ifs.filg.uj.edu.pl/
· Instytut Filologii Wschodniosłowiańskiej - http://www.ifw.filg.uj.edu.pl/
· Instytut Językoznawstwa http://www.jezykoznawstwo.filg.uj.edu.pl/
· Katedra do Badań nad Przekładem i Komunikacją Międzykulturową - http://www.unesco.uj.edu.pl/
Wydział Filozoficzny
· Instytut Filozofii - http://www.iphils.uj.edu.pl/
· Instytut Psychologii - http://www.psychologia.uj.edu.pl
· Instytut Religioznawstwa - http://www.religioznawstwo.uj.edu.pl/
· Instytut Socjologii - http://www.socjologia.uj.edu.pl
· Katedra Porównawczych Studiów Cywilizacji - http://www.psc.uj.edu.pl
Wydział Historyczny
· Instytut Judaistyki - http://www.judaistyka.uj.edu.pl
· Instytut Etnologii i Antropologii Kultury - http://www.etnologia.uj.edu.pl
· Instytut Historii - http://historia.uj.edu.pl
· Instytut Historii Sztuki - http://www.ihs.uj.edu.pl
· Instytut Muzykologii - http://www.muzykologia.uj.edu.pl
Wydział Polonistyki
http://www.polonistyka.uj.edu.plWydział Studiów Międzynarodowych i Politycznych
· Instytut Amerykanistyki i Studiów Polonijnych - http://www.iaisp.uj.edu.pl/
· Instytut Bliskiego i Dalekiego Wschodu - http://www.orient.uj.edu.pl/
· Instytut Europeistyki – http://www.europeistyka.uj.edu.pl/
· Instytut Nauk Politycznych i Stosunków Międzynarodowych - http://www.inp.uj.edu.pl/
· Instytut Rosji i Europy Wschodniej - http://www.rosjoznawstwo.uj.edu.pl/
· Instytut Studiów Międzykulturowych - http://www.ism.uj.edu.pl/
· Katedra Ukrainoznawstwa - http://www.ukrainoznawstwo.uj.edu.pl/
Wydział Zarządzania i Komunikacji Społecznej
· Instytut Dziennikarstwa, Mediów i Komunikacji Społecznej - http://www.media.uj.edu.pl/
· Instytut Ekonomii, Finansów i Zarządzania - http://www.econ.uj.edu.pl/
· Instytut Informacji Naukowej i Bibliotekoznawstwa - http://www.inib.uj.edu.pl/
· Instytut Kultury - http://www.kultura.uj.edu.pl/
· Instytut Przedsiębiorczości - http://www.turystyka.uj.edu.pl/
· Instytut Psychologii Stosowanej - http://www.ips.uj.edu.pl/
· Instytut Spraw Publicznych - http://www.isp.uj.edu.pl/
· Instytut Sztuk Audiowizualnych - http://www.film.uj.edu.pl